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除了结构性影像，其他的影像学都可以被称为功能影像学。脑功能成像是一种基于血氧浓度依赖性（BOLD）的脑功能成像技术，其基本原理是通过脑内血氧饱和度的改变来反映脑功能状态。按其实施方式可分为两类：静息态（Resting-state fMRI,rs-fMRI）和任务态（Task fMRI,tfMRI）。

因为动物难以完成某些具体的工作，所以在小动物中，常用的方法就是静息态的研究。所谓的静息态，就是在没有任何介入的情况下，将动物放入核磁1共振仪中，对其进行扫描。目前，已有的研究主要集中在静息态，即低频段（ALFF）和局部一致性（ReHo）等。另外，基于动物静息态数据我们还可以通过计算不同脑区BOLD信号的相关系数研究大脑功能连接（Functional connection,FC)，更深层的基于功能连接的网络图还可进行图论相关指标的分析，如小世界“（small world）属性、“富人俱乐部”（rich club）等。目前，在阿尔兹1海默症和帕金1森病等与学习记忆和认知功能障碍有关的动物模型中，应用多的小动物功能影像学。

核磁1共振（MRI）是目前仅有的一种可活1体组织中代谢物进行无创检测的方法。一般情况下，由于氢原子处于不同的化学环境，其进动频率也会有所差别，从而使MRS谱线产生的化移也会有所差别，从而可以用来判定化合物的类型和含量。目前，小动物MR波谱主要被用来探测脑内代谢产物的变化，比如N-乙酰门冬氨酸酯（NAA)，胆1碱（Cho)，肌酸（Cr)，乳酸（Lac）等，因而在脑胶质瘤， AD, PD，脑缺血等脑内代谢产物的变化方面具有非常重要的作用。

肠道炎1症检测

模型：小鼠肠道感1染。

显像方式：口腔灌喂泛影葡胺和泛影酸钠，18F-FDG或18F-DFAC，200-250μCi静脉注射，1hr后静态扫描10min。

意义：通过D-FAC成像，显示小鼠肠道炎1症情况。

骨1髓缺失A20引发关节炎

模型：C57BL/6小鼠。

显像方式：18F-FDG-PET，0.5mCi注射。

意义：18F-FDG-PET结果表明免1疫调节基因A20敲除导致小鼠关节炎。