正如电子管电路向晶体管电路和集成电路发展时所经历的那样，核酸杂交技术的集成化也已经和正在使分子生物学技术发生着一场革命。现在全世界已有十多家公司专门从事基因芯片的研究和开发工作，且已有较为成型的产品和设备问世。主要代表为美国 Affymetrix 公司。该公司聚集有多位计算机、数学和分子生物学，其每年的研究经费在一千万美元以上，且已历时六七年之久，拥有多项。
目前，由于灵敏度所限，多数方法需要在标记和分析前对样品进行适当程序的扩增，不过也有不少人试图绕过这一问题，如 Mosaic Technologies 公司引入的固相 PCR 方法，引物特异性强，无交叉污染并且省去了液相处理的烦琐； Lynx Therapeutics 公司引入的大规模并行固相法 (Massively parallel solid-phase cloning) ，可在一个样品中同时对数以万计的 DNA 片段进行，且无需单独处理和分离每个。
基因芯片是一种中小型剖析设备，能够迅速和准确地科学研究生物基因信息。制做基因芯片时，可以用机械手臂把很多已经知道或不明编码序列的DNA片段点在玻璃镜片(一般为2cmX2cm)、铜片或尼龙膜上，再经物理吸附功效做到固定化(cDNA芯片)。可以直接在金属板或金属表层开展有机合成，从而获得寡聚核糖核苷酸芯片。
1. 数据可靠分析
因为用基因芯片进行杂交分析，每次实验结果都会有些变化，因为包括靶DNA浓度、探针浓度、杂交双方的序列组成、盐浓度以及温度等许多因素影响了杂合双链的形成和稳定性。因此，需要进行重复试验以确保数据的准确。主要的方法是通过两次平行杂交反应，将每个基因在两个反应中的表达水平做成对应散点图，只要绝大多数基因的杂交结果都在45度斜线附近，就说明实验结果是可的。