水产养殖尾水中的主要污染物有氨氮、有机物、磷及污损生物。水产养殖尾水如得不到及时、有效处理，不仅恶化养殖水域环境，而且会导致鱼类、虾类、贝类等的爆发性疾病，甚至大面积死掉，养殖产品质量和产量下降。因此，养殖生产不仅需要采取科学的投喂和管理，还需做好池塘尾水处理工作。
养殖尾水处理常见的有物理处理技术、化学处理技术、生物处理技术三种
有一些传统的方法已经被国家明令禁止了 比如使用硫酸铜、漂白l粉、孔雀石l绿等水质改良剂虽然也能对养殖后的废水进行一定的处理，但由于这些方法会对环境产生二次污染，并且有的方法还会对人体造成伤害，现在已经被国家明令禁止了，对环境友好的除污方法才符合国家的生态保护战略。
改造出生态处理系统也可以对池塘养殖污水进行处理它的方式是将水塘、沟渠、洼地等改造成生态治理系统，材料主要由各种水生、陆生植物、经济鱼类以及少量的砾石、碎石等组成，这种方法投资会小一些，并且系统运行无需外加动力，日常维护简单，运行成本低，对P、N的去除效率也比较高，能有效控制水体富营养化的发生。这种生态处理系统不仅仅解决了水产养殖污染问题，还节省了水资源，同时可以实现水产品的，是水产养殖业的发展趋势。
水中存在着大量的死l亡有机体、鱼类的排泄物以及残存饵料的分解物，这些有机物分解会产生氨氮、亚硝l酸盐、硝l酸l盐等不利于鱼类健康生存的物质。另外，池塘中的大部分可溶解有机物是细菌的营养物，有机物的增加为细菌繁殖提供了良好的环境条件。有机物的分解还需要消耗池塘中的氧气，长期缺氧导致水质恶化，不利于鱼类的生存和健康生长。一些沉积营养的积累，属于资源的浪费，还会对水产环境造成不同程度的的污染，影响生物生存。