虽然如此，多数学者从自闭症的主要症状，提出以生物学论为基础，说明行为(症状)—神经心理功能—脑部运作等三个层次之间具有因果链(causal chains)的关系，而此关系亦同时说明了自闭症的症状与独特性。为了符合前述理论，多数学者认为以下的叙述可以作为原因的解释：自闭症系因生物学上的病因，如脆弱X染色体症候群或染色体异常(特别是第7、8、13、15、17、18对发生率多；
早期；一般说来，孤独症患儿的预后好坏与发现疾病苗头早晚、疾病严重程度、早期言语发育情况、认知功能、是否伴有其它疾病、是否用药、是否训练等多种因素有关。心理学研究发现，孤独症的实质的损害是认知障碍，表现在早期的分享性注意和扮演行为上。分享性注意是指与他人共同分享对某种事物的兴趣，当孤独症面对一种物品时不是与他人分享兴趣。
2000年，中国儿童人口数量为2.9亿左右，占总人口的22.89%，自闭症儿童约占了儿童总数的0.6%。而且不能否认，还有许多自闭症儿童没有被发现、诊断，更说不上治的疗。中国的自闭症儿童患者人数和治的疗矫正方面都始终面临巨大的挑战。自闭症是个“疑症”，就国内、国际医的疗水平还没有找到它的病因，对自闭症儿童的所有生理检查结果都是正常的。
自闭症是个“疑症”，就国内、国际医的疗水平还没有找到它的病因，对自闭症儿童的所有生理检查结果都是正常的。但是可以断定，自闭症是先天性的脑发育障碍疾病，是神经系统的疾病，并且将终身伴随，不能治的愈。国外象美国、英国、日本等发达国家诊断、治的疗自闭症已经有40多年的历史，积累了许多成功的经验。实践证明，经过早期正确地、坚持不懈地干预，许多自闭症儿童是能够融入社会、自立生活的。