环境保护相关部负责排污许可制度的统一监督管理，制订相关政策、标准、规范，指导地方实施排污许可制度。省、自治区、直辖市环境保护主管部门负责本行政区域排污许可制度的组织实施和监督。
建设、运行、维护、管理国家排污许可证管理信息平台，各地现有的排污许可证管理信息平台应实现数据的逐步接入。在统一社会信用代码基础上，通过国家排污许可证管理信息平台对的排污许可证实行统一编码。
排污许可证详细记录企业的基本产污环节、治理设施、排污口设置、主要污染物排放许可量等信息，对各环节技术标准规范、台账管理以及污染物排放标准等进行了严格规定，实现从污染预防到污染治理和排放控制的全过程监管。
排污许可证，城镇排水许可证业绩遍及多个行业，多个类型，排污许可证代办类型：重点管理，简化管理，登记管理，涉及行业造纸厂， 茶厂，涂料行业，矿采选业，发电站，垃圾填埋场，沥青搅拌站，机制砂，食品厂，化妆轻工业，电子加工业，养殖业，金属制品加工等，排水证涉及的主要行业：餐饮，洗车等需要排水的商户。
排污许可证年度执行报告具体包括：排污单位基本情况、污染防治设施运行情况、自行监测执行情况、环境管理台账执行情况、实际排放情况及合规判定分析、信息公开情况、排污单位内部环境管理体系建设与运行情况、其他排污许可证规定的内容执行情况、其他需要说明的问题、结论、附图附件等。
对于排污单位信息有变化和违证排污等情形，应分析与排污许可证内容的差异，并说明原因。