产地不同：普通鸭蛋大部分都是在内陆小湖小泊中人工养殖的鸭子产的蛋，海鸭蛋是由海边城市天然放养的海鸭所产的蛋。
喂食饲料不同：普通鸭蛋一般以人工饲料或者湖中的淡水鱼为食，为了保证其质量以及产蛋的数量，一般主要还是人工饲料为主，而海鸭蛋是由海边城市天然放养的海鸭所产的蛋，其主要以海中的小鱼、小虾、小螺以及小蟹为食，无添加，这种海鸭十分肥美。
营养价值不同：食用海鸭蛋对人体多么有益，关键是其营养不仅丰富，但是其胆固醇含量还只是鸡蛋的50%，而普通鸭蛋营养价值就比海鸭蛋营养价值就逊色很多。
咸鸭蛋有以下几种腌制方法：一：①将准备腌制的鸭蛋洗净，沥干水。②准备高度白酒一小碗，盐小半碗，装鸭蛋的玻璃罐或瓷坛一个(用开水洗干净，晾干)。③将沥干水分的鸭蛋在白酒中全部浸湿，再在盐中滚一滚，然后放入罐子中，密封好。④将罐子放置在阴凉地方15~20天，取出煮熟，就可以食用了。二：①将欲腌制的鸭蛋洗净，沥干。③适量八角、生姜、花椒用水煮出香味，加适量白糖和白酒搅匀成卤水。③用黄土(或草木灰)加熬制的卤水、加500克盐，搅拌成泥糊，再将鸭蛋逐个放入泥糊中均匀粘上泥糊，放入容器内密封好。④20天后取出鸭蛋洗净泥土，煮熟后食用。
咸鸭蛋的饮食禁忌：
很多人在吃饭的时候喜欢来个咸鸭蛋当做下饭菜，而且大家买咸鸭蛋的时候，也喜欢买有油的。但是很多人会有疑问，又咸又油的咸鸭蛋，但是在食用时也是有一些禁忌的。
1、孕妇、脾阳不足者不宜食用。
2、咸鸭蛋含盐量高，有些病患要少吃或尽量不吃。
3、健康人群每次吃尽量不超过半个咸蛋，因为每100g咸鸭蛋中，钠含量高达2700mg（膳食推荐量一天是2200 mg）。一个咸蛋差不多60～70g，意味着你吃1个咸蛋，这一天差不多不用吃盐了。所以吃半个适宜，同时要少吃其他高盐食物及含钠调味品，吃后应该多喝水。
咸鸭蛋的食用历史悠久，早在南北朝时的《齐民要术》中就有记述：“浸鸭子一月，煮而食之，酒食具用。”说的就是咸鸭蛋。很多地方都有腌制咸鸭蛋的习俗，在当涂有名的咸鸭蛋就是石臼湖红心咸鸭蛋。石臼湖水域宽广，无公害，无污染源，夏涨冬落，贯注长江，水质明净清澈，微甜呈中性；湖里的水草丰美，鱼、虾、螺、蚯蚓众多……当地自由放养的湖阳麻鸭，以此天然水生物为食，得其养份精华，故蛋心自然鲜红，含有丰富的蛋白质及人体所需的多种微量元素。