产地不同：普通鸭蛋大部分都是在内陆小湖小泊中人工养殖的鸭子产的蛋，海鸭蛋是由海边城市天然放养的海鸭所产的蛋。
喂食饲料不同：普通鸭蛋一般以人工饲料或者湖中的淡水鱼为食，为了保证其质量以及产蛋的数量，一般主要还是人工饲料为主，而海鸭蛋是由海边城市天然放养的海鸭所产的蛋，其主要以海中的小鱼、小虾、小螺以及小蟹为食，无添加，这种海鸭十分肥美。
营养价值不同：食用海鸭蛋对人体多么有益，关键是其营养不仅丰富，但是其胆固醇含量还只是鸡蛋的50%，而普通鸭蛋营养价值就比海鸭蛋营养价值就逊色很多。
禽类蛋的蛋黄中本来含油量就比较高，但由于是以乳化(洗碗的洗洁精就是油脂的乳化剂)状态存在，所以和我们一般见到的“油”不一样。经过长时间的腌制，乳化状态的油的性状发生改变，所以当我们切开咸鸭蛋，就会有油流出来。所以，油多的咸鸭蛋并不是腌制的好，大部分是因为选用了含油量高的鸭蛋而造成的。
高渗溶液中氯化钠等进入鸭蛋中，鸭蛋中的氯化钠成分会越来越多，达到和外界水平一致。而蛋黄中的成分则会在盐和其他成分的作用下发生变化，只要经过足够长的时间，腌鸭蛋也都会出油的。
咸鸭蛋的腌制步骤：
1、鸭蛋清洗干净表面的脏东西，然后放到太阳底下晾晒一下，晒干表面的水分，千万不能留有水分，不然很容易坏。
2、然后我们把洗干净沥干水分的鸭蛋放入一个大碗里，倒入适量的高度白酒浸泡半个小时，这一步非常的关键，大家一定不要省略。
3、浸泡好的鸭蛋裹上一层盐，裹好盐的鸭蛋用纸巾包起来，包好的鸭蛋浸泡到白酒中沾上一层白酒，再次沾上一层盐，再用保鲜膜把鸭蛋包起来，包裹的严实一点，不要留有空气。
4、包裹好的鸭蛋先放到太阳底下暴晒一天，这样可以加速鸭蛋出油，然后把鸭蛋放到阴凉的地方腌制7天左右，鸭蛋就腌制好了。
吃过不少咸鸭蛋，但还是忍不住要跟大家分享这款咸香味美、沙酥流油“烤”海鸭蛋。有人说尝过这个“烤”海鸭蛋再瞧不上其它的。海鸭蛋不只是普通咸鸭蛋，还是一个香得流油的“烤”海鸭蛋。小愚买了一箱，每一个都起沙流油，蛋白柔嫩不干，蛋黄细腻通红。相信尝过的人，应该是再瞧不上其它的了。每一个自由的海鸭蛋，经传统方法腌制过后，再用古法烤制，便成了当地特色的“烤海鸭蛋”。烤过之后的海鸭蛋带有独特香烤味，比普通咸鸭蛋更鲜美。