经保税区出口的货物，即报关单上的运输方式显示“非保税区”，有两种业务模式：
一是销售给境外但按客户要求运入保税区仓储后离境；
二是直接出口货物，但需要进保税区拼箱。
这两类经保税区出口的货物在申报出口退税时，新金税三期申报系统中必须要在明细申报表中的“业务类型代码”栏勾选BSQ，否则无法申报。
出口企业在申报运输方式显示“非保税区”报关的退税时，会有疑点提示，提示税务机关审核出境备案清单内容及企业填写的出口日期是否准确。其中这个出口日期，由于24号公告中对这类货物的退税率等是以备案清单的出口日期来判断，因此，出口退税申报系统中要求申报的出口日期是以出境备案清单显示的出口日期来填写。
出口企业必须知道企业出口地区是否符合海关的特殊监管区域，一般这种业务在申报时会有疑点“出口国别为中国境内”这个疑点是一个中性疑点，税局会根据出口退税的金额大小或者是否有其他疑点来判断是否对出口企业进行核查。一般情况是给企业直接退税，核查时主要的问题是出口企业是否存在“保税一日游”的问题。
这种业务的特点是报关单上的运抵国填写的是“中国境内”。
订舱时，除了正常的单据外，还须提供以下单据：危险品货物中英文说明书(副本)、海运出口危险货物包装容器使用鉴定结果单、海运出口危险货物包装容器性能鉴定结果单(纸箱包装)注：有时需提供装箱证明。订舱时如果危险品不同类，则危险货物的订舱必须按各类不同危险特性分别办理订舱配船，以便船方按各种不同特性的危险货物按照《国际海运危规》的隔离要求分别堆装陨运输，以利安全。