感受完这种粗糙度之后，2010年就有人把疏水蛋白引入到检测中，改善这种基质表面抗体堆积不均匀的情况。疏水蛋白能够自组装形成10nm厚的两亲性膜，疏水性一侧贴在疏水性的聚板上，亲水性的一侧伸向溶液中，可以物理吸附抗体，用于组装一抗。石英晶体微天平结果显示在pH=5时，聚板上形成一层致密的膜；X射线光电子能谱和水接触角测试显示疏水蛋白修饰后，疏水的聚板能够保持长达3个月的亲水性；原子力显微镜结果显示，连接到疏水蛋白上的抗体也终于站起来了，是一种“end-on”的取向排列。
目前已有多种方法可以将寡核苷酸或短肽固定到固相支持物上。这些方法总体上有两种，即原位合成（ in situ synthesis ）与合成点样两种。支持物有多种如玻璃片、硅片、聚膜、纤维素膜、尼龙膜等，但需经特殊处理。作原位合成的支持物在聚合反应前要先使其表面衍生出羟基或氨基（视所要固定基因芯片的分子为核酸或寡肽而定）并与保护基建立共价连接；作点样用的支持物为使其表面带上正电荷以吸附带负电荷的探针分子，通常需包被以氨基硅烷或多聚赖氨酸等。
为了提高dna分子的稳定性，通常将dna固定在固态基质表面。dna的共价固定在pcr、分子检测等领域拥有广泛的应用，现有技术中，常用共价固定dna分子的技术主要包括利用肽键的方式、利用各种硅烷偶联剂的方式、利用巯基的方式等，常用于dna固定化的固态基质有金刚石、金属、金属氧化物、陶瓷、塑料等，上述材料拥有良好的物理性能，然而由于上述材料多孔结构的制备较为复杂，所以通常dna是直接固定在材料的外表面上。