1.2净化水质，增加溶氧
虾蟹在肥水中生长慢，且容易生病。池塘中种植大量水草，可吸收水中大量的营养盐类，使水转清，同时可通过水草的光合作用产生大量氧气，加速水中有机物的氧化分解，有利于净化水质，促进虾蟹健康生长。
1.3营造良好的生态环境，提高虾蟹品质
水草为虾蟹提供栖息、蜕壳的良好生态环境，可明显提高虾蟹的成活率和回捕率。高温季节水草还可吸收太阳能，降低池水温度，利于虾蟹生长。养出的虾蟹背青肚白，品质与天然生长相似。
不论沉水植物是否存在,藻类的生物量与湖水中氮、磷的含量呈正相关 。但藻类生命周期短，对水体中氮、磷营养盐固定能力弱，而沉水植物具有过量吸收营养物质的特性，个体大，生活周期长，体内积累的氮、磷多，储存较藻类稳定，能有效降低氮、磷循环速度、控制藻类的暴发 。
对于根系不发达的沉水植物如黑藻、伊乐藻、金鱼藻等,主要依靠自身叶片吸收水体中的营养盐，如NO3-、PO43-、CO2和HCO3-，进而与浮游植物形成竞争关系。研究表明，大量沉水植物可以导致水体中磷含量急剧下降，造成浮游植物缺乏营养盐而难以在夏天形成水华。
通过对梁子湖与湖北省其他四个不同水深的湖泊间菹草石芽萌发率月动态的野外调查和萌发实验，发现无光环境下菹草石芽的萌发率较有光下的小;五个湖泊的石芽均于7月初即开始萌发，相同月份不同湖泊石芽的平均萌发率基本与其平均水深成负相关关系，但12月初各湖泊的平均萌发率相近(>95%);同一湖泊水深越大，相同月份的萌发率越低，水深的增加能显著推迟萌发起始时间，但不改变其终萌发率(12月初>95%)。进一步研究发现在光照和缺乏基质的条件下，菹草石芽的萌发率和出苗率提高，光对菹草萌发苗根的生长无促进作用。
二、生态作用
沉水植物在水生生态系统中的地位。几乎所有的相关报道都认为，沉水植物给水生动物提供更多的生活栖息和隐蔽场所，又可以增加水中的溶氧，净化水质，扩大水生动物的有效生存空间，同时，沉水植物的幼嫩部分又可供水生动物摄食，从而改善整个水生生态系统。
三、常见的沉水植物
1.苦草
科属：水鳖科，枯草属。
别名：蓼萍草，扁草。
特征：沉水草本；具匍匐茎，径约2毫米，白色，光滑或稍粗糙，先端芽浅黄色；叶基生，线形或带形，长20-200厘米，宽0.5-2厘米，绿色或略带紫红色，常具棕色条纹和斑点，先端圆钝。