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骨小梁模式因子（Tb.Pf）用于形容骨小梁表面凹凸程度，其与结构模式指数（SMI），是描述小梁结构组成结构中板层结构和杆状结构比例的参数。如果结构中骨小梁主要为板层结构，那么SMI接近于0；反之，如果主要是杆状骨小梁，SMI则接近3。发生骨质疏松时，骨小梁从板状向杆状转变，该值增大。2）各向异性程度（DA）用于评价骨小梁的方向性和对称性，指椭圆体截距长度平均值（MIL）中长径和短径的比值，该比值越大说明各向异性程度越大。在骨质疏松早期，承重骨小梁DA值通常增加，随着骨质疏松加剧，DA会减小。3）骨小梁连接密度（Conn.D）表示每立方毫米体积中骨小梁网状结构之间的连接数量。
越来越多的科研人员在使用大鼠的颌骨作为牙1科相关领域的研究模型。牙槽骨是颌骨的一部分，包围着牙齿，是牙齿重要的支撑组织。牙槽骨也是牙周系统或骨骼系统中具活力的组织。牙槽骨的重塑不仅与局部因素（牙齿萌出、咬合功能、牙齿脱落和正畸牙齿移动）有关，还与还与性激1素和营养等因素有关。这些生理和病理特征突出了牙槽骨研究的必要性。通过显微CT对大鼠的颌骨内部结构进行精细观察并且定量分析，可为形态学观察和疾病研究提供有力的影像数据支撑
等分割测量可对腹部等扫描区域进行多20等分的等分割测量，从而更有效地观察细微变化（正常，病变，等）。
呼吸同步扫描和心跳同步扫描拍摄对象的呼吸运动会导图像混乱、扭曲、画质下降等，采用呼吸、心脏的同步扫描技术，可以根据心脏的扩张与收缩同步扫描，从而显著提高图像质量。
融合成像可以通过3D软件，将PET、光学等成像设备得到的探针积聚等信息，与CT图像获得的结构信息融合到一起，以得到被测部位的综合信息。
扫描速度快，动物受到的辐射小普通的小动物CT扫描剂量在200-600mSv的范围，对动物损伤大，不利于长时间观察。而LCT200的辐射剂量小于10mGy，且只针对扫描部位，不会辐射到动物体其他部位。
