清洗消毒前，清洗消毒人员要着的洁净工作服、鞋、橡胶手套等，并备有照明用具和清洗工具进入水箱，消毒操作时还应戴防护眼镜和口罩。使用的清洗消毒工具要，使用前经消毒清洁，不得对水箱造成污染。清洗消毒时，要先关闭进水阀门等阀门，将水箱中的水通过排水管排净。清洗消毒人员遵循先池顶后底，由里向外的原则，对水箱进行清刷除垢。
管道清洗是采用化学方法或者物理方法对管道内表面污垢进行清除，达到清洗目的，保证管道内表面恢复原来表明材质的过程。管道清洗的方法有很多，常用的管道清洗方法有：化学清洗、高压水清洗、PIG清管、排灰管管道清洗、注水管管道清洗等。管道清洗后会在干净的金属表面形成一层致密的化学钝化膜，钝化膜可以有效的防止污垢的再次产生有效的对设备进行保护，保证设备的安全性和延长设备的使用寿命。
清洗消毒的简略程序：公示告知业主→邀请相关人员作为现场监督→清洗前停水→穿戴工作服进入水箱→排净水箱内的残水，并使用工具对水箱内壁进行清刷除垢→使用符合要求的消毒剂对水箱内壁进行涂喷→人员退出水箱，盖上水箱盖密闭30分钟→打开进水阀，排空消毒液→使用自来水进行反复清洗→整理用具并带离水箱→进水并取样检测→检测合格后可正常使用→做好记录并由现场监督人员签字确认，存档备查→向业主公示清洗和检测情况。