目前，纸巾纸的生产原料复杂，有棉浆、木浆、草浆、废纸边、废纸等。用棉浆生产的纸巾纸质量好，但其产量极低，市场上难寻踪迹。用废纸边、废纸作原料生产的产品，产品质量一般在中、低档范围，一般来说强度较低，易掉毛、掉粉，有的见水就散，夏天用来擦汗时，纸毛就容易粘在脸上。有些KTV客户订做成本低一些的中等KT纸巾，有些KTV客户订成本高一些的品牌纸质，比较好的抽纸巾质量。
纸巾纸并非越白越好。纸巾纸产品标准中规定A等品的白度为85.0%～90.0%，有些生产企业为了提高产品白度，过量添加荧光增白剂，致使纸巾纸的白度超过90.0%，白度不符合标准的要求，这样的产品表面看起来白的不自然、色调不柔和。
有异味不能用：有的厂家生产卫生纸应用的原料主要是麦草和三级生活废纸，细菌严重超标，不得不使用大量化学药品进行消毒，但不论采用什么措施也清除不掉纸中的异味，消费者使用以后会引起多种疾病。