档案整理时应根据实际情况灵活针对性处理
在进行档案级整理时，通常根据档案管理的文件要求，分别按照产品型号、编号、项目、设备型号等分类对这几类档案进行整理，但在具体的整理工作中，常会遇到某一产品、某一设备、某一项目的资料不全，甚少的情况如仍按照上述要求进行分类，会导致档案子类目数量不断增加，数量过多影响档案信息的查找和管理，反而人为地增加了档案管理的复杂性。
档案分类要注意详细划分来规避不利影响
档案进行分类时，通常要求按照产品型号、设备型号、项目编号等进行子类的划分，并根据子类进行整理组成案卷，但在具体整理工作中，时常出现部分文件无法归属于哪个具体的型号或项目的情况，或者文件与几个型号或项目都存在着一定的关联性，这会加大档案组卷难度。档案资料的利用价值，即使属于同一产品、同一设备或同一项目也有所区别，同时也会影响档案资料的保管期限，但在实际整理过程中，档案组卷后，通常会将这些不同保管期限的档案集中管理，并进行装订固化，不仅不利于后期检索利用，同时也对后期档案价值鉴定工作的有序开展造成阻碍。且在档案整理工作中，档案信息著录通常以案卷为著录单位，而未对该卷的每份档案信息逐一进行著录，这样会导致档案信息内容不够明确，对后期档案信息的开发利用造成不利影响。
灵活运用档案整理方式有利于后期的管理和检索工作开展
按照不同档案内容，对其合理的整理方法进行专项制定。对文书类档案和其他零散类别档案的方法和要求进行确定；使文件级档案整理得以实现。通过这种整理方式能够使事业单位、其他机关的同类档案整理方法实现统一，使管理中存在的差异性和矛盾等问题得以有效解决。针对企业档案中的科学技术专项研究类、产品类、设备仪器、基本建设类等档案资料需要结合档案资料的具体情况，对适合档案自身特点的整理方式进行灵活选择和运用，更有利于后期档案管理和检索工作的开展。
积存零散档案整理需要熟悉立档单位及档案历史和现状
积存零散文件的整理，一般是从研究立档的历史沿革和档案状况开始的。只有熟悉了立档单位及其档案的历史和现状，才能深刻地了解和掌握被整理档案的各种特点，才能正确地解决整理工作中一系列的实际问题。对立档单位历史沿革和档案状况研究的结果，应写成书面材料，通常称为“立档单位和全宗历史考证”，这个作为整理工作方案的一部分，或作为单行材料。