该检测方法是普遍采用的检测方法,相比我准的检测方法,如多管发酵及滤膜法具简便快捷，其选择性培养基具有抑制杂菌的作用，假阳性低
酶底物法为GB5750-2006收录的用于大肠检测标准方法，酶底物法是目前水中大肠检测的方法，目前以其方便快捷，假阳性低，适用大量样品快速检测等优点正逐步被国内检测所认可。
相对于多管发酵和滤膜法，酶底物法检测步骤大大减少，而且对实验环境要求不高，检测时间可减少到24小时，在日常水样监测及应急监测中具有很好的应用前景，可及时检测，预防，较大限度的减少重大公共安全事故的发生几率。
检测原理：
该检测方法采用大肠产生β-半乳糖苷酶分解色源底物-onPG(Ortho-nitrophenyl-β-D-galactopyranoside)使培养液呈黄色。大肠埃希氏菌产生β-葡萄糖醛酸酶（β-glucuronidase）分解MUG（4 - methyl-umbelliferyl-β-glucuronide）使培养液在波长366 nm 紫外光下产生荧光的原理,来定性定量水中总大肠菌群、粪大肠菌群（耐热大肠菌群）及大肠埃希氏菌。
程控定量封口机常见问题故障及对应解决方法
酶底物法检测大肠菌群实际操作方便快捷，假阳性低，结果准确，是GB5750-2006生活饮用水卫生标准检验方法中检测大肠菌群的规范方法，作为此方法中关键的配套仪器——程控定量封口机，在实验中是要经常使用的。而仪器设备在使用过程中，由于操作等问题，免不了会出现一些故障，从而影响到实验的进行。
大肠繁殖迅速，培养容易，变异容易被检出，因此是生物学上的重要实验材料。大肠对于分子遗传学的建立和发展以及生物工程的兴起发挥了重要作用。用大肠生产人的生长释放抑制因子已经取得了成功。人的生长释放抑制因子是从人脑、肠、中分泌出来的一种神经，具有抑制胰岛素和胰素的分泌，对肢端肥大症、急性炎和等患者有作用。
滤膜法(MF，membranefilter)滤膜法：是目前为流行的检测水中大肠群的方法。滤膜法的具体步骤是首先将一定量的水体样本注入0.45μm的滤膜过滤，经过抽滤，水中的细菌则被留在滤膜上，将滤膜贴于品红亚硫酸钠培养基上培养24h，温度为恒温37℃，这使得菌群因发酵乳糖而使得滤膜出现紫红色，通过计算滤膜上的菌落进而计算出单位样本中的大肠的数量。
用ISO9308－1规定的滤膜法测定水中大肠回收率均值为94.7%，批内变异系数小于10%，检出限为500mL水样可检出1个CFU。该方法费用较低、原理简单、利于推广，但检测时间相对较长、步骤繁琐、干扰因素多，不适于大量样品的分析，无法满足污染物品快速检测需求。