目前微反应器在化工工艺过程的研究与开发中已经得到广泛的应用，商业化生产中的应用正日益增多。其主要应用领域包括有机合成过程，微米和纳米材料的制备和日用化学品的生产。在化工生产中，新的Miprowa技术已经可以实现每小时上万升的流量。
微反应器的微结构大的缺点是固体物料无法通过微通道，如果反应中有大量固体产生，微通道极易堵塞，导致生产无法连续进行。
目前这一问题主要是通过改进反应器的设计来解决。例如拜耳-埃尔费尔德微技术公司开发的阀式混合器（反应器）可以用于快速沉淀反应，基于这一技术，拜耳公司成功开发了商业化生产工艺，用于生产高的性能的微米材料和纳米材料。
连续流化学提高了化学反应的效率
连续流化学是将比色分析自动化的一种分析测试系统，样品溶液泵入分析模块后可以自动进行样品前处理如消解，蒸馏，透析，萃取，前处理过的样品溶液被均匀的小气泡分割成连续的片段，再将试剂以特定的比例和顺序加入到每个片段的样品中，然后边流动，边混合，边反应，生成颜色物质通过比色计检测吸光度，得到相应的峰值电信号，再通过与标准曲线比较自动计算得到相应的浓度。
微通道反应器使工艺过程更加简单
微通道反应器有多种几何结构，简单的是管式结构，还有板式结构、微通道结构以及集成试剂混合、换热、溶剂交换、相分离等多种功能为一体的复合式结构。微通道反应器制作材料种类繁多，包括玻璃、硅、陶瓷、金属和聚合物等，要针对化学反应的温度、压力、腐蚀性、比热容等特性选择合适的制作材料。