SSR分子标记的原理是什么？
SSR标记又称为sequence tagged microsatellite site,简写为STMS，是目前最常用的微卫星标记之一。
由于基因组中某一特定的微卫星的侧翼序列通常都是保守性较强的单一序列，因而可以将微卫星侧翼的DNA片段克隆、测序，然后根据微卫星的侧翼序列就可以人工合成引物进行PCR扩增，从而将单个微卫星位点扩增出来。
由于单个微卫星位点重复单元在数量上的变异，个体的扩增产物在长度上的变化就产生长度的多态性，这一多态性称为简单序列重复长度多态性(SSLP)，每一扩增位点就代表了这一位点的一对等位基因。
由于SSR重复数目变化很大，所以SSR标记能揭示比RFLP高得多的多态性，这就是SSR标记的原理。
ssr分子标记适用于二倍体植物吗
不适用。二倍体植物的分子系数过大，ssr分子无法进行标记，所以不适用。植物是生命的主要形态之一，包含了如树木、灌木、藤类、青草、蕨类，及绿藻、地衣等熟悉的生物。
SSR标记的介绍
SSR(Simple Sequence Repeats)标记是近年来发展起来的一种以特异引物PCR为基础的分子标记技术，也称为微卫星DNA(MicrosatelliteDNA),是一类由几个核苷酸（一般为1~6个）为重复单位组成的长达几十个核苷酸的串联重复序列。由于每个SSR两侧的序列一般是相对保守的单拷贝序列。生物的基因组中，特别是高等生物的基因组中含有大量的重复序列〔14〕，根据重复序列在基因组中的分布形式可将其分为串联重复序列和散布重复序列。
SSR分子标记是怎样进行植物基因定位的
SSR分子标记是怎样进行植物基因定位的
在真核生物的基因组中,每个SSR序列的基本单元重复次数在不同基因型间差异很大,因此形成其座位的多态性,并且每个SSR座位两端有一段保守的DNA序列,可以根据此保守序列设计引物,利用PCR技术进行扩增,然后用高浓度琼脂糖凝胶或变性聚丙稀酰胺凝胶电泳进行分析.由于SSR多态性是由简单序列重复次数的差异引起的,因此在扩增的PCR带上会出现小片段或不连续的带.由此可见,SSR分子标记的基本原理就是要了解SSR座位两侧的核苷酸序列,寻找其中的特异保护区.
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